干货 | RNA-seq之R语言富集分析，KEGG、GO和GSEA实战详解
2024年3月25日 · KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes） 是一个包含生物系统功能和信息的数据库资源，提供了关于基因组、化学物质、代谢途径、疾病和药物等方面的信息 …
【陈巍学基因-3】small RNA-seq - 简书
2018年12月5日 · 通过对表达差异的micro RNA和它对应的靶基因进行KEGG分析，可以把可能被影响到的通路进行富集分析。 这个图，就是KEGG分析的结果。 在此图中，KEGG富集的程 …
生信工具教程| KEGG富集分析工具使用与解读详细教程 - 知乎
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库是系统地分析基因功能、链接基因组信息和功能信息的数据库，包括代谢通路（pathway）数据库、分层分类数据库、基因数据库 …
差异基因没办法富集到通路你就放弃了吗 - 知乎
在R里面的实现方式也是非常的简单： kk_gse <- gseKEGG(geneList = geneList, organism = 'hsa', nPerm = 1000, minGSSize = 10, pvalueCutoff = 0.9, verbose = FALSE) tmp=kk_gse@result. …
The GO and KEGG analysis for predicted target mRNAs of …
Purpose: Adherence capacity is one of the principal virulence factors of Streptococcus mutans, and adhesion virulence factors are controlled by small RNAs (sRNAs) at the post …
善用KEGG数据库挖掘目的基因 - CSDN博客
2024年5月24日 · KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一个包含生物信息学数据库和相关工具的综合性资源，旨在帮助研究人员理解生物系统的功能和组成。 KEGG数据库 …
Profiles of Small Regulatory RNAs at Different Growth Phases of
2021年11月30日 · Small regulatory RNAs (sRNAs), generally 50–400nt in length, are well established as key genetic regulators in prokaryotes (Wagner and Romby, 2015). sRNAs act …
PsRNA: A Computing Engine for the Comparative Identification of ...
A computational engine has been built to search within the intergenic regions to identify and roughly annotate new putative sRNA regions in Enterobacteriaceae genomes. It utilizes …
Small noncoding RNA discovery and profiling with sRNAtools …
2019年12月24日 · The sncRNA target output contains the list of predicted sncRNA target genes and their functional annotation with enrichments of Gene Ontology, KEGG pathways and other …
sRNAdeep: a novel tool for bacterial sRNA prediction based on ...
2024年10月31日 · In this study, we propose a novel sRNA prediction model called sRNAdeep based on the DistilBERT feature extraction and TextCNN methods. The sRNA and non-sRNA …