SMART-Seq Human TCR (with UMIs)是一款具有更高重复性和特异性的TCR NGS文库构建试剂盒。 该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5' end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。

Analysis of TCR amplicon libraries with UMIs Data libraries. This tutorial uses the data from the publication: Simon S, Voillet V, Vignard V, et al, PD-1 and TIGIT coexpression identifies a circulating CD8 T cell subset predictive of response to anti-PD-1 therapy, Journal for ImmunoTherapy of Cancer 2020;8:e001631. doi: 10.1136/jitc-2020-001631

分子标签（Unique Molecular Indentifier，UMI）是一段随机化或特定的核苷酸短序列，通常设计为完全随机的核苷酸链（如NNNNNN），部分简并核苷酸链（如NNNRNYN， R | Y：可以是ATCG中的一种）或者固定核苷酸链（在模板分子有限的情况下）。

2021年1月6日 · Many experimental and bioinformatics approaches have been developed to characterize the human T cell receptor (TCR) repertoire. However, the unknown functional relevance of TCR profiling...

T细胞介导的抗原识别取决于T细胞受体（TCR）与抗原主要组织相容性复合体（MHC）分子的相互作用。所有T细胞的TCR总和称为TCR库（TCR repertoire），每个人的TCR库是高度多样化的，这种多样化有利于识别更多的外源抗…

2019年10月29日 · TRUmiCount算法基于PCR扩增和测序的力学模型，PCR效率和测序深度这两个参数具有直接的物理解释，无需校准实验或插入即可从实验数据中估算出来。 我们展示了我们的模型捕获了扩增和测序的主要随机特性，它允许我们过滤掉幻像UMIs，并估计测序过程中丢失的分子数量。 最后，我们证明了由TRUmiCount计算的经过数字滤波和损失校正的分子计数可以测量真实的分子数量，其准确度远远高于不同UMIs的原始数量，即使大多数UMIs仅按单细胞RNA-Seq …

2021年5月16日 · 免疫组库（immune repertoire, IR）是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和，在自身免疫疾病、传染病、癌症等多种疾病中扮演者至关重要的角色，也正因此免疫组库一直是各领域的研究重点。 免疫是人类和脊椎动物最重要的防御机制，在暴露于外来抗原后产生特异性抗体。 T细胞介导的抗原识别取决于T细胞受体（TCR）与抗原主要组织相容性复合体（MHC）分子的相互作用。 TCR是高度多样化的异源二聚体，由大多数T细 …

Simple PCR amplification: a single primer pair for each TCR (alpha or beta) subunit per reaction; UMI-based correction: removal of reads derived from PCR duplicates and sequencing errors; Sensitive and specific clonotype detection: optimized cDNA library generation

该试剂盒提供唯一分子标签序列（umi），用于对起始分子的鉴别。 通过对受体序列的深入分析，揭示复杂的免疫系统; 对 b 细胞受体（bcr）和 t 细胞受体（tcr）进行富集和测序; 制备 b 细胞和 t 细胞的全长免疫组库; 使用唯一分子标签序列（umi）准确定量转录本

SMART-Seq Human TCR (with UMIs) leverages the SMART® technology (Switching Mechanism at 5′ End of RNA Template) and employs a 5′ RACE-like approach to capture complete V(D)J variable regions of TCR transcripts.