Introduction - MEME Suite
2024年8月29日 · You can use the MEME Suite tools to discover novel (Motif Discovery) or known (Motif Enrichment) sequence motifs in sets of related DNA, RNA or protein sequences. You …
如何进行Motif预测分析和解读？MEME和HOMER全解析 - 知乎
MEME主要基于 多重期望最大化 （EM）算法，通过迭代计算来寻找序列中最可能的motif模式。 HOMER则是通过对基因组数据进行统计分析，结合已知的转录因子结合位点信息等，识 …
MEME使用-motif分析（生物信息学工具-24） - CSDN博客
2024年6月20日 · Motif分析是一种在 生物信息学 和计算生物学中广泛应用的技术，用于识别DNA、RNA或蛋白质序列中具有生物学功能的短保守序列模式（motif）。 这些motif通常与特 …
MEME 的安装和使用 - 简书
2022年2月22日 · MEME 是最基本的挖掘 Motif 模块，可以在 少量（<50） 的序列中挖掘 全新（novel）、无间隙（ungapped） 的 Motif。 如果序列中存在长度不定的 Motif，MEME 会将 …
motif分析工具——MEME-CHIP - 知乎 - 知乎专栏
Motif 是DNA、RNA或蛋白质中频繁出现的短序列模式，能通过结合其他分子调控基因表达。 目前主流工具包括 HOMER （Homer Software and Data Download）和 MEME套件 …
如何使用MEME预测序列motif？_分析 - 搜狐
2021年8月4日 · 做基因家族分析或者其他一些需要同时展示一个序列集合的保守序列区域（motif或者pattern的时候），最常用的工具，应该是MEME suite。 MEME Suite是集合众多预测和注 …
MEME - MEME Suite
MEME splits variable-length patterns into two or more separate motifs. A motif is an approximate sequence pattern that occurs repeatedly in a group of related sequences. MEME represents …
基因家族-MEME Motif鉴定 - 知乎 - 知乎专栏
motif 是出现在一组相关基因中含有某种特征的短序列，其上面往往含有一些 转录因子 识别的位点。 motif分析则是通过将得到的蛋白序列提交到 MEME （meme-suite.org/index.ht）进行预 …
Motif Databases - MEME Suite
2024年8月29日 · The MEME Suite Motif-based sequence analysis tools. Motif Databases [Click a category to show its available databases. Within a category click a database to see details.] …
MEME:motif分析的综合性工具 - 简书
2019年7月24日 · MEME是一个motif分析的工具箱，提供了多种相关工具，网址如下. 根据分析目的和功能，将相关工具划分成了以下4大类别. 1. Motif Discovery. 这部分工具用于预测输入序 …