
RNA甲基化修饰m6A检测热门技术—MeRIP-seq - 知乎 - 知乎专栏
MeRIP-seq(高通量测序法)作为m6A修饰的检测方法,其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在;能够明确每个基因的修饰水平,进行组与组之间比较等优势。
干货:m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析 - 深圳 …
2022年6月24日 · 研究表明,m6A已知的最主要功能是调控mRNA的稳定性:胞质内经过m6A修饰的mRNA可以被YTHDF2识别,使其富集到Processing body(P-body)从而加速mRNA的降解。 此外,m6A修饰还可以改变RNA的二级结构、调控microRNA的靶标识别来调控mRNA的稳定性。 在核内,m6A修饰可以调控RNA的剪接、出核过程,从而调控基因表达。 m6A还可能与DNA甲基化存在互作关系。 下图展示了部分目前已知的m6A与生物功能的关系: 图2:m6A与生物学 …
RNA m6A甲基化修饰和特定基因m6A位点的检测方法|干货分享
选择性丙烯基化学标记测序( m6A-SAC-seq )可以直接标记m6A,覆盖几乎所有m6A经典motif,并以单碱基分辨率定量分析捕获的m6A位点。该方法使用特定酶将烯丙基化学基团添加到m6A中,形成a6m6A,经I2处理后进行环化。
m6A-SAC-seq for quantitative whole transcriptome m6A profiling …
2022年3月14日 · We developed m 6 A-selective allyl chemical labeling and sequencing (m 6 A - SAC-seq) 23 as an advanced site-specific sequencing method with broad application potential,...
甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验流程 - 知乎
甲基化RNA免疫共沉淀 (MeRIP-seq/ m6A-seq)实验流程. 从样品处理到最终数据获得中每一个环节都会对数据质量和数量产生影响,而数据质量又会直接影响后续信息分析的结果。
技术贴 | RNA甲基化修饰m6A的检测——MeRIP-seq - CSDN博客
2024年6月27日 · MeRIP-Seq(Methylated RNA Immunoprecipitation sequencing)是一种用于系统检测RNA甲基化修饰的技术,其原理是利用针对m6A的抗体来富集含有m6A修饰的mRNA片段,并通过高通量测序技术对这些片段进行测序。
Detection of m6A from direct RNA sequencing using a multiple
2022年11月10日 · This work presents m6Anet, which implements a neural-network-based multiple instance learning model to detect m6A modifications from direct RNA sequencing data.
Nature Biotechnology丨胡璐璐与合作者报道m6A定量测序新方法
最早的m6A修饰的全转录组图谱发表于2012年(m6A-Seq 或者 MeRIP-Seq),使用m6A抗体富集含有m6A的RNA片段,产生分辨率100~200 nt的图谱。 目前RNA...
Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq ...
2012年4月29日 · Here we present the human and mouse m6A modification landscape in a transcriptome-wide manner, using a novel approach, m6A-seq, based on antibody-mediated capture and massively parallel...
Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq
2012年4月29日 · Here we present the human and mouse m(6)A modification landscape in a transcriptome-wide manner, using a novel approach, m(6)A-seq, based on antibody-mediated capture and massively parallel sequencing. We identify over 12,000 m(6)A sites characterized by a typical consensus in the transcripts of more than 7,000 human genes.