从上面对比图可以看出，在新冠病毒的刺突蛋白序列上的计算机模拟实验表明，LinearDesign算法可以设计出比Wildtype序列稳定得多的结构，而且设计时间只需要 1个半小时。 如果采用线性时间近似，所需时间可以进一步缩短到16分钟， 而相比于最稳定序列，线性近似算法设计出的序列与其能量仅相差0.6%。 上图对比了刺突蛋白的野生型mRNA、随机生成的mRNA序列、以及LinearDesign设计序列的稳定性和蛋白质表达水平。 图中横坐标是衡量稳定性的参数MFE， …

Algorithm for Optimized mRNA Design Improves Stability and Immunogenicity (LinearDesign)

这是指一种在大面积暗色背景下，使用渐变、模糊、动态流光、极细描边、微噪点、外发光以及庄重的无衬线字体，外加流畅克制的微动效来组织和修饰界面元素的网页设计风格。 其独特又神秘的锋利质感，就是为了体现界面所承载产品的专业感。 这种风格早已在国外设计圈流行多时，很多产品也都纷纷推出了 Linear 设计风格的网页。 大家可能在各种概念设计稿上见过 Linear 设计的影子，只是叫不出它的名字，或者并不知道这种风格源自于同名的一款 SaaS 软件。 老规矩，先 …

2023年4月17日 · 这是指一种在大面积暗色背景下，使用渐变、模糊、动态流光、极细描边、微噪点、外发光以及庄重的无衬线字体，外加流畅克制的微动效来组织和修饰界面元素的网页设计风格。 其独特又神秘的锋利质感，就是为了体现界面所承载产品的专业感。 这种风格早已在国外设计圈流行多时，很多产品也都纷纷推出了 Linear 设计风格的网页。 大家可能在各种概念设计稿上见过 Linear 设计的影子，只是叫不出它的名字，或者并不知道这种风格源自于同名的一款 SaaS …

In this article, we’ll explore the principles of linear design, its practical applications, and how to implement it effectively in collaborative projects. Key Takeaways. Linear design is inspired by the SAAS product Linear, known for its professional and modern look.

目前LinearDesign直接开发的序列设计工具只到“长度 < 500aa / 1500nt“，尚不太能满足绝大多数的抗原设计需求，普通实验室的研发工作者如果不能氪金的话，我觉得不妨简单粗暴把全平台的密码子优化工具试一试，然后跑一下MFE值（很多工具可以），然后用MFE值先粗筛一遍，选择MFE值更小的几个Candidates构建测一测表达量，再选择TOP3-5测一测动物抗体，最终获得一个可能还行的序列设计。 最后，我想说的是，大多数博主提到这个是基于AI的mRNA序列设计平台，但 …

2024年3月1日 · In this article you’ll learn what linear design is, what the benefits and problems are with linear design, and how to use linear design effectively — hopefully without appearing copy-paste and with a twist on your take. What is Linear design? Linear design is a design trend popularized by the SaaS product, Linear. Linear streamlines ...

2022年8月30日 · 百度 团队研发出来的LinearDesign采用MFE+CAI的优化方式是对于一个特定的CAI，该算法可以挖掘到MFE最小的候选mRNA序列，拓宽可供挖掘的mRNA序列范围。 此外，在mRNA序列优化时，还需要 考虑编码区5'端避免出现二级结构和茎环结构。 采用LinearDesign设计的Spike mRNA序列（A-D）在小鼠体内出发的抗体滴度比只采用CAI（H）高出9-20倍。 百度 LinearDesign序列优化原理. 研发人员通过一系列的体外体内试验来验证通过LinearDesign优 …

2024年10月11日 · lineardesign: 可执行文件，用于运行LinearDesign程序。 testseq: 测试序列文件。 2. 项目启动文件介绍. lineardesign: 这是项目的可执行文件，用于启动LinearDesign程序。 --lambda LAMBDA 或 -l LAMBDA: 设置LAMBDA，一个平衡MFE和CAI的超参数（默认值为0.0）。 --codonusage FILE_NAME 或 -c FILE_NAME: 导入密码子使用频率表（默认使用人类密码子使用频率表）。 --verbose 或 -v: 打印更多详细信息（默认关闭）。 3. 项目配置文件介绍. …

2023年12月26日 · Linear 设计风格，大多以深色背景、直线几何元素、渐变动效、粒子噪点等设计为主，强调简洁、创造出现代、具有科技感和未来感的界面。 清晰的布局：Linear 设计风格大多会使用对齐、均匀分布和对称性来创造清晰的布局。 让页面看起来直观易用。 直线和几何形状：Linear 设计风格都会使用直线、角度和几何形状来构建设计元素。 比如普通的线条、直角、平行线、圆角矩形、三角形等形状，以创造简洁和现代感。 平面化设计：Linear 设计风格通常使 …