核糖体rRNA分类-功能应用-数据库-Silva - 知乎 - 知乎专栏
Sliva数据库全称（SILVA ribosomal RNA database），是一个核糖体的rRNA基因序列数据库，用来检查和比对RNA序列, 既可以针对小亚基,SSU，16S/18S，也可以针对大亚基, …
微生物菌群多样性-注释数据库（原核微生物） - 知乎
Sliva数据库全称（SILVA ribosomal RNA database），是一个核糖体的RNA数据库，其提供全面的三个生命域（细菌、古细菌和真核生物）中的小亚基（简称SSU，包括16S/18S，SSU）和 …
常用的物种分类鉴定基因或序列 | 陈连福的生信博客
2024年3月25日 · rDNA序列能转录出的前体RNA（pre-RNA，precursor RNA）包含LSU rRNA和SSU rRNA，以及两者之间的5s或5.8s rRNA。 在该前体RNA序列上不同rRNAs的内部并 …
Nature综述——真菌的多样性：真菌的高通量测序及鉴定-CSDN博客
2018年12月25日 · 对于ssu和lsu，作者分别推荐silva ssu ref nr 和rdp 数据库。 通过SSU区域研究丛植菌根真菌建议使用Maarja-AM。 近期三个较新的数据库：International Nucleotide …
系统发育 从基因组中提取barcode序列 - 知乎 - 知乎专栏
常见的用于真菌分类的DNA barcodes （DNA条形码）有ITS， LSU， SSU， RPB2， TEF等等。 在真菌分类学中，物种的鉴定主要基于形态学，和多Barcoddes联合构建进化树的方式。
SILVA 数据库 - 简书
2023年6月21日 · sliva rRNA数据库（http://www.arb-silva.de/）用来检查和比对RNA序列，既可以针对16S/18S,SSU，也可以针对23S/28S, LSU，包括了Bacteria, Archaea and Eukarya。同 …
Nature子刊：用16S及18S rRNA全长进行微生物多样性研究 …
2021年9月30日 · 研究人员开发了一种新型方法，通过结合poly(A)尾巴和SSU反转录序列，实现了高通量无引物合成全长SSU序列，大大减少了PCR偏好性和嵌合体产生的偏差。 在多种环境 …
Fungal Identification by Sequencing: LSU, SSU, and ITS Regions
2023年5月8日 · The ribosomal DNA sequence (rDNA), either from the large subunit (LSU) or small subunit (SSU), information can be used for organizing fungi into taxa. The intervening …
【求助】LSU、SSU与18s、28s有什么关系
2010年5月2日 · 请问，核糖体大小亚基LLU,SSU基因序列和核糖体18s rRNA基因，28s rRNA基因是不是一回事呢?
DNA barcoding of arbuscular mycorrhizal fungi
2010年4月23日 · DNA barcoding analyses were performed with datasets from several phylogenetic lineages of the Glomeromycota. We tested a c. 1500 bp fragment spanning small …