2023年6月16日 · N50、N90是评估基因组组装质量的指标。 例如，一个1M基因组经测序拼接后，按长度从大到小排序，当累积长度达到总长度50%时，对应的那个contig或scaffold的长度即为Contig N50或Scaffold N50，数值越大表示组装质量越好。 N90则是累计到总长度90%时对应的片段长度，同样反映了组装的完整性。 摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 > What’s N50? | The Molecular Ecologist.

l50: 这是指达到n50阈值所需的最少序列数量。换句话说，它是组成总序列长度一半的最长序列的数量。 n75和l75: 这些指标与n50和l50相似，但它们是基于覆盖至少75%总序列长度的阈值来计算的。 n90和l90: 这些是基于覆盖至少90%总序列长度的阈值来计算的指标。

In computational biology, N50 and L50 are statistics of a set of contig or scaffold lengths. The N50 is similar to a mean or median of lengths, but has greater weight given to the longer contigs. It is used widely in genome assembly, especially in reference …

在 计算生物学 中，N50和L50是Contigs (重叠群)或脚手架长度的统计值。 N50的计算方式类似于平均值或中位数，但是对长Contigs的权重更大。 这种方法广泛运用于 序列组装 中，特别是在参考组装草稿内的Contigs长度中。 这种度量常被用来描述基因组装配 (有时还有其他装配)的“完整性”。 但它的本质是告诉你一些关于Contigs长度分布的信息。 [1] N50根据连续性定义装配质量。 按照序列长度的顺序排列你的集合中的所有Contigs。 首先是最长的Contigs，然后是第二长 …

2024年6月9日 · 通过计算各种指标来评估基因组的组装，包括N50,L50，GC含量等contig基本信息。 QUAST (Quality Assessment Tool for Genome Assemblies)是 基因组 质量 评估 工具，基于python开发，matplotlib绘图。

2019年10月23日 · N50，L50和NG50是评价genome assembly的quality的标准，评价长度时使用N50，N50是一个contig的长度。 不选用genome size的50% 是因为1.这是估计的size值不一定准；2.sequence 仅覆盖80%。 评价数量使用L50，L50数量越小越好。 NG50表达测到genome 覆盖度。 取材方法很重要，得到目标数据。 Assembly 算法有可能带来更多误差，通常二代测序和三代测序相结合。 贪心算法原理是每一步都在找最优解，最后得到最好的结果，优点是快，缺点 …

QUAST(Quality Assessment Tool for Genome Assemblies)是基因组质量评估工具，通过计算各种指标来评估基因组的组装，包括 N50, L50 ， GC含量 等 contig 基本信息。 QUAST基于python开发，matplotlib绘图。

在计算生物学中， n50和l50是一组重叠群或支架长度的统计数据。 N50与长度的平均值或中位数相似，但重叠群的重量更大。 它被广泛用于基因组组件中，尤其是指草稿组件内的重叠长度。

L表示角钢，50表示该角钢的宽为50毫米，5表示角钢厚为5毫米。 1、这是指角钢的截面几何尺寸，与角钢的长无关。 上述型钢是等边角钢，二条边都是50毫米。 2、也有不等边的角钢。 如50*40*5，则是指角钢的一条边宽50毫米，另一条边为40毫米，厚为5毫米。 3、角钢的规格用边长和边厚的尺寸表示。 目前国产角钢规格为2—20号，以边长的厘米数为号数，同一号角钢常有2—7种不同的边厚。 进口角钢标明两边的实际尺寸及边厚并注明相关标准。 4、一般边 …

2024年12月17日 · 因此，N50的定义可以表述为"使得累加后长度超过组装总长度一半的contig的长度就是N50"。 文章浏览阅读7.3k次，点赞9次，收藏15次。 N50定义比较绕口，有一种只可意会不可言传的感觉，所以索性看图N50和NG50假设一个基因组的大小为10，但是这个值只有神知道，你得到的信息就是组装后有3个contig,长度分别为"3,4,1,1"，所以组装总长度为9。 为了计算N50，我们需要先把contig从大到小排列，也就是"4,3,1"。 然后先看最大的contig，长度是4， …