
IGV: Integrative Genomics Viewer
Generate self-contained HTML reports that consist of a table of genomic sites and associated IGV views for each site. All IGV software is open source - MIT License.
ChIP-seq/DAP-seq/ATAC-seq/CUT&Tag结果可视化-IGV使用攻略
2024年3月18日 · 本文详细介绍了ChIP-seq、DAP-seq、ATAC-seq和CUT&Tag等技术在生物学研究中的作用,重点讲解了如何利用IGV工具进行转录因子结合、组蛋白修饰等信号的可视化。
保姆级 IGV 基因组浏览器使用指南(图文详解) - CSDN博客
2021年8月6日 · 资源摘要信息:"igv是生物信息学领域中的一款重要基因组浏览工具。该工具专为处理和分析基因组学研究中的高通量测序数据而设计,能够以直观的方式展示出复杂的数据结果。igv支持多种数据格式,其中最常见的是bam、vcf...
保姆级 IGV 基因组浏览器使用指南(图文详解) - 知乎
如果没有在桌面找到 IGV 软件,按住 Win 键,搜索 igv 可以找到并运行. IGV 有下载文件的需求,所以通过网络访问权限. 二、软件介绍 1、数据载入. 为了方便介绍功能,我们需要先下载几个测试数据: 测试数据下载:
IGV Desktop Application
The Integrative Genomics Viewer (IGV) is a high-performance, easy-to-use, interactive tool for the visual exploration of genomic data. It supports flexible integration of all the common types of genomic data and metadata, investigator-generated or …
Data Tracks - IGV Desktop Application
The Integrative Genomics Viewer (IGV) is a high-performance, easy-to-use, interactive tool for the visual exploration of genomic data. It supports flexible integration of all the common types of genomic data and metadata, investigator-generated or …
IGV——基因组可视化:高阶教程 - CSDN博客
2024年10月4日 · IGV(Integrative Genomics Viewer)是一个高性能的可视化工具,可以交互式的察看综合的基因组相关数据,友好的支持多种数据类型,包括芯片、二代测序和基因组注释数据等。IGV是基于Java的工具,且在不断更新当中,不同版本的IGV可能需要不同的Java版本。
【基因组学】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果 - 简书
官网的使用手册包含以下18个方面,我主要关注的是 Viewing Data 和 Viewing Alignments。 1. Viewing Data. IGV的一条track代表一个样本或试验,每条track,IGV都会展示track identifier,一个或多个属性,和track数据,如图所示。 当导入文件时,IGV会根据文件的后缀名自动识别文件。 如下图所示。 IGV可以像曼哈顿图那样展示GWAS数据。 2. Viewing Alignments. 看的最多的比对文件就是下机数据比对到基因组的sam/bam文件。 导入IGV的bam要附带着它的索引文件,这个 …
Integrative genomics viewer - Nature Biotechnology
2011年1月1日 · IGV supports concurrent visualization of diverse data types across hundreds, and up to thousands, of samples and correlation of these integrated data sets with clinical and phenotypic...
Integrative Genomics Viewer (IGV): high-performance genomics data …
The Integrative Genomics Viewer (IGV) is a high-performance viewer that efficiently handles large heterogeneous data sets, while providing a smooth and intuitive user experience at all levels of genome resolution.