ChIP-seq/DAP-seq/ATAC-seq/CUT&Tag结果可视化-IGV使用攻略
2024年3月18日 · 本文详细介绍了ChIP-seq、DAP-seq、ATAC-seq和CUT&Tag等技术在生物学研究中的作用，重点讲解了如何利用IGV工具进行转录因子结合、组蛋白修饰等信号的可视化。
m6A、ATAC等表观文章中的peak可视化图形如何实现？ - 知乎
要绘制peak峰图需要用到一款软件—IGV（Integrative Genomics Viewer），这是一款基于java的免费软件，可对基因组各类数据进行整合与可视化，软件官网还贴心地为科研人提供 …
IGV——基因组可视化：高阶教程 - CSDN博客
2024年10月4日 · IGV 支持芯片数据，NGS 数据，基因组注释等多种类型的数据，各种类型的信息以行为单位进行展示，称为 track，不同类型的 数据可视化 方式不同。 官 …
浏览器时下窗口可视区域宽度_Peak可视化步骤丨IGV查 …
2021年1月14日 · IGV(Integrative Genomics Viewer)是一款本地的探索基因组数据的可视化浏览器，它拥有多个系统版本，支持多种不同类型的输入格式，包括芯片测序、二代测序、基因组注 …
使用pyGenomeTracks绘制表观展示图 - 简书
2020年9月17日 · 数据类型一般甲基化、ATAC和ChIP都可以用bedGraph格式文件，基因组注释用UCSC12列bed格式文件，而Hi-C数据需要提供HicPro的矩阵文件。 制作配置文件，需要用 …
ATAC-seq分析干货-2 - 简书
2020年2月22日 · Model-based Analysis of ChIP-Seq (MACS2) 是用来检测DNA片段富集的软件，尽管当时是针对Chip-seq开发的，但是其非常好的适用于ATAC-seq。现在ATAC-seq主流 …
结合CHIP-seq和ATAC-seq结果进行分析 - 简书
2019年12月16日 · （一）利用IGV同时查看Chip-seq和ATAC-seq的结果 拿到所有CHIP-seq和ATAC-seq的bw文件，可以在IGV里将这些文件一起导入，然后搜索基因cdc25b，查看基因附近 …
ATAC-seq分析干货 - 哔哩哔哩
2020年8月7日 · ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing)，利用超活性的Tn5转座酶容易结合在开放染色质的特性，通过Tn5酶切割基因 …
ATAC-seq的经典差异分析 - 生信菜鸟团
ATAC-seq的数据分析主要是检测信号峰值，就是peaks，不同样品的peaks的差异主要是两个思路，使用韦恩图展现有无peaks的差异，另外就是使用散点图展现高低强弱的peaks差异。
GUAVA: A Graphical User Interface for the Analysis and …
2018年7月17日 · Output interface of GUAVA allows users to easily view these normalized ATAC-seq signals on the IGV. With one click, the ATAC-seq data track, peaks and genome will be …