一分钟读完全文介绍了如何在R语言中实现GAMM模型。 介绍了模型主要的适用范围以及其在应用于空间面板数据上的优势。 介绍了spline curve及tensor product在模型中的使用。 介绍了如何绘制及解释模型结果。 相关成果已…

2024年4月28日 · In essence, GAM and FDA are the same in that they use the addition of basis functions to model complex curves. Fitting GAMM in R is achieved using the mgcv package and data visualization is usually achieved using the itsadug 1 package. GAMM can be fitted using the gam function, but more often it is fitted using bam for very large datasets.

2021年9月19日 · 本文主要采用mgcv包中gamm函数分析。 文献1. 这篇文章是基于MIMIC-III数据库2021年5月份发表在Frontiers in Medicine（IF=5.091分）上的文献。 收集ARDS患者入院后7天内重复测量的NLR值，结局变量：30天死亡率和院内死亡率；作者①首先采用多因素Logistic回归，并拟合光滑曲线探索基线NLR与结局变量之间的相关性；②进一步采用广义相加混合模型（GAMM）用于分析死亡者和存活者之间NLR差异随时间的早期变化。

2023年5月11日 · What is GAMM? Generalized Additive Mixed Models (GAMMs; Wood 2017) are an extension of Generalized Linear Mixed Models that allow for more flexible modeling of nonlinear relationships between the depdendent and independent variables.

这些方法被称为 广义线性混合建模 (GLMM)和 广义加性混合建模 (GAMM)，这应该不足为奇;见图13.1右侧通路。 主要的信息是，在应用GLMM或GAMM时，尽量保持模型简单，否则您可能会遇到数值估计问题。 用二项GLM会消耗很多自由度，这是我们改用GLMM的一个原因。 R中有各种各样的函数可以用于GLMM;主要的是 MASS包 中的glmmPQL、 lme4包 中的 lmer 和glmmML包中的glmmML。 在图13.3的GLMM中，粗线是典型农场的长度效应。 因此，由于随机截距a i, …

Generalized additive mixed effect models (GAMMs) are a type of statistical model that combines the flexibility of generalized additive models (GAMs) with the ability to account for random effects in mixed-effect models.

将指定的广义加性混合模型 (GAMM) 与数据进行拟合，在正常错误身份链接情况下通过调用 lme ，否则通过调用 gammPQL （ MASS 库中 glmmPQL 的修改版）。 在后一种情况下，估计值只是近似的 MLE。 该例程通常比 gam 慢，并且在数值上不那么稳健。 要使用 lme4 代替 nlme 作为底层拟合引擎，请参见包 gamm4 中的 gamm4 。 平滑在调用 gam 时指定为固定效应模型公式的一部分，但平滑的波动分量被视为随机效应。 lme 可用的随机效应结构和相关结构用于指定其他 …

2014年4月2日 · log是数据变换，取对数可以把大范围的数变成小范围的数，这在将几组相差太大的数据画在同一个坐标轴时特别有用，比如一组数据范围是1～10，第二组数据范围是10～100000000，要是不对第二组取常用对数，第一组在坐标轴上只是一点点，都看不到，对第二组取常用对数后，第二组范围变成1～8了，这样两组数据都能看到了。 下面尝试将两个变量同时作为解释变量。 k是什么？ k is the dimension of the basis used to represent the smooth term. If …

GAM在mgcv中的主要优势是它可以进行交叉验证，并允许广义加性混合建模 (GAMM)，包括空间和时间相关性以及嵌套数据和各种异质性模式。 交叉验证是一个自动确定最佳平滑量的过程。 假设我们的目标值深度= 1500m。 在这个目标值周围选择一个特定大小的窗口，假设目标值的两边都是500米，窗口从1000米延伸到2000米。 窗口内的所有观测结果都用黑点表示，窗口外的观测结果用开圈表示。 现在的目标是获得目标值 (用三角形表示)处的源数量的值。 存在多种选择;我们 …

2023年5月11日 · What is GAMM? Generalized Additive Mixed Models (GAMMs; Wood 2017) are an extension of Generalized Linear Mixed Models that allow for more flexible modeling of nonlinear relationships between the depdendent and independent variables.