Whole exome and transcriptome sequencing reveal clonal ... - Nature
2021年8月27日 · On liver metastasis-private later-stage CNV chr8q, the gene PXDNL with significantly different mutational frequency was associated with the CRC prognosis. These …
Novel liquid biopsy CNV biomarkers in malignant melanoma
2024年7月9日 · Initially, we examined copy number variations (CNV) in CDK genes (CDKN2A, CDKN2B, CDK4) using MLPA (gDNA) and ddPCR (ctDNA) analysis. Subsequently, low …
Copy number variation in plasma as a tool for lung cancer …
CfDNA concentration, arm 10q, 3q, 8q, 3p, and 22q are key features for prediction. Trained XGBoost classifier is a potential method for lung cancer detection.
单细胞和Bulk转录组测序鉴定了结直肠癌的两种肿瘤上皮细胞状态…
通过推断的染色体拷贝数变异（CNV）从所有五个队列的上皮细胞转录组中推断拷贝数变异，观察到iCMS2普遍有7pq，8q，13q和20pq的增加，并有1p，4pq，8p，14q，15q，17p和18pq的 …
Chromosome 8 gain is associated with high-grade transformation …
CNV analysis by whole genome sequencing (WGS) and scRNA-seq demonstrated Chr8q gain in MPNST. In addition to coding sequence mutations and transcriptional expression, copy …
Nature | 利用空间转录组解析良、恶性组织的拷贝数变异|Nature|体细胞|CNV…
2022年8月10日 · 来自英国牛津大学、瑞典皇家理工学院等的研究团队，基于空间转录组学来推断良性和恶性组织的空间拷贝数变异（copy number variations，CNVs），揭示了肿瘤内与附近 …
焦老师讲遗传系列之12：拷贝数变异CNV - 知乎专栏
拷贝数变异 (Copy number variation, CNV)，是由基因组发生重排而导致的,一般指长度1KB以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少, 主要表现为亚显微水平的缺失和重复。
8q Gain Has No Additional Predictive Value in
2023年10月16日 · Gain of chromosome 8q has been associated with poor prognosis in uveal melanoma (UM), and an increase in the absolute number of 8q-copies correlated with an even …
自己写代码计算单细胞转录组数据的CNV及绘制热图 | 生信菜鸟团
2018年3月25日 · 前面我们提到过broad开发了工具来对单细胞转录组数据计算CNV及绘制热图，因为这个方法学本来就是他们建立起来的。 我也拿那个软件在普通的bulk转录组数据，CCLE数 …
Hepatology丨陈孝平/张必翔/张占国合作揭示1q中的CNV驱动基因…
2023年1月26日 · 肝细胞癌 (HCC)的发病机制复杂，涉及表观遗传和遗传变化，包括突变和拷贝数变异 (CNVs)的积累【1-3】。 虽然有研究报道了HCC中CNV位点和一些特定基因拷贝数的改 …