2022年5月11日 · BCR和TCR有三个高变区CDR1、CDR2、CDR3，其中以CDR3变异最大，直定了抗原结合特异性，对于B细胞和T细胞多样性的研究也就集中在CDR3 区。 BCR的CDR3区包括轻链V、J基因片段和重链V、D、J基因片段，TCR的CDR3区包括α链V、J基因片段和和β链V、D、J基因片段。 因此，称为VDJ. 一般的免疫组库测序（Immune Repertoire sequencing (IR-SEQ)）大致分为两类：多重PCR测序和5' RACE技术。 市面上以多重PCR测序为主，其原理 …

单细胞免疫组库测序（5’scRNA + TCR / BCR）技术是一种能够在单细胞层面同时解析细胞转录组信息和 T 细胞受体（TCR）、B 细胞受体（BCR）基因重排情况的前沿技术，这项技术为深入理解免疫细胞的发育、分化、抗原识别机制等提供了可能。 在疾病研究中，无论是感染性疾病、自身免疫病还是肿瘤，它都像是一把精准的钥匙，帮助我们开启探索免疫反应奥秘的大门，为诊断、治疗和疫苗研发等应用领域带来全新视角。 一、数据来源背景介绍. 在机体免疫系统中 T 细胞受 …

2020年4月9日 · 该部位因在空间结构上可与抗原决定簇形成精密的互补，故超变区又称互补性决定区 (complementarity determining region，CDR)。 整个抗体分子可分为恒定区和可变区两部分。 在可变区内有一小部分氨基酸残基变化特别强烈，这些氨基酸的残基组成和排列顺序更易发生变异区域称高变区。 在L链、H链的V区中有三个高变区 (hypervariable regions，HVR)，该部位因在空间结构上可与抗原决定簇形成精密的互补，故高变区又称互补性决定区。 互补决定区||百科. …

BCR基因在 V-D-J重排 之后，在B细胞抗原亲和力成熟过程中可变区会发生体细胞高频突变（SHM），SHM主要集中在CDR区域，所以BCR的研究最好对可变区的全长进行分析。 TCR重排之后不再发生SHM，所以一般情况TCR分析CDR3区域就可以了。 如果需要对可变区的全长序列进行分析，需要进行长读长测序，市面上常见的测序类型可以选择PE250或PE300，但长读长测序成本比较高。 如果只需要对CDR3区域进行分析，短读长测序就够了，市面上常见的测序类型可 …

人体的适应性免疫系统主要依靠于 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞表面的 T 细胞受体（TCR）和 B 细胞受体（BCR）上的互补决定区（CDR）与 MHC-抗原肽分子进行识别并特异性结合。 大量研究表明对 BCR 或 TCR 进行测序可用于诊断 B 或 T 淋巴细胞恶性肿瘤及追踪治疗后效果。 因此，对免疫组库进行测序以及长期监测是疾病早期发现、诊断以及疗效预测评估的重要方法。 因此，近年来研究人员逐渐将科研关注点集中在肿瘤、自身免疫性疾病以及炎症和传染病等不同疾病条件下的 …

Clonotyping starts with grouping reads based on sequence similarity to infer a shared ancestor without SHM or INDEL. In general, homology comparison is conducted for clonotyping using sequences of CDR3, the most variable region in BCR, and under the highest selection pressure during affinity maturation.

2013年8月22日 · We found that (a) splenic BCR CDR3 length distributions are characterized by low standard deviations and few local maxima, compared to peripheral blood distributions; (b) healthy elderly people's BCR CDR3 length distributions can be distinguished from those of the young; and (c) a machine learning model based on TCR CDR3 distribution features ...

cdr3是v(d)j基因编码的核心区域，通常会包含v基因的一部分，然后d基因，还有j基因的一部分，因此是bcr或者tcr上最具有代表性的，最具有辨识度的一段区域，相当于一个人的脸。

6 天之前 · Simultaneously, it provides characteristics of corresponding B-cell V(D)J(C) recombination and CDR3 repertoire, thereby enabling a comprehensive understanding of the BCR-antigen epitope correspondence features of various B-cell subsets at a large scale, assessing their antigen-binding capabilities, and dissecting the molecular mechanisms ...

Complementarity-determining region 3 (CDR3) is the most hyper-variable region in B cell receptor (BCR) and T cell receptor (TCR) genes, and the most critical structure in antigen recognition and thereby in determining the fates of developing and responding lymphocytes.