Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞（single cell），而bulk测序代表一群细胞（a population of cells）。 我们都知道单细胞转录组测序能够解决常规转录组测序无法解决的细…

2020年9月30日 · 为了明确单细胞测序分析结果的准确性，可以利用相同样本的 Bulk RNA-Seq 数据进行评估。Bernard Thienpont et al 采用此方法评估了肺癌组织单细胞数据是否受组织解离影响。

2022年3月6日 · Bulk RNA-Seq 差异表达分析流程 以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章，现在整理为流程，同时修改一些错误。 流程包含质控、比对、定量、差异分析。

2024年6月13日 · Bulk RNA-Seq 差异表达分析流程 以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章，现在整理为流程，同时修改一些错误。 流程包含质控、比对、定量、差异分析...

转录组测序（bulk RNA-Seq）分析主要包括 上游数据处理，下游数据分析。 上游数据处理是指将测得的原始的reads变成基因表达矩阵。 下游数据分析是指对表达矩阵根据生物学问题和意义进行可视化分析。

2020年11月12日 · 对于Bulk RNA-seq测序（用于比较转录组学，如不同物种的同种组织样本，也就是我们常说的常规转录组测序，注意和单细胞测序区分），我们常用的分析流程有很多，之前的文章也有介绍。

bulk RNA-seq下游分析部分，我们已经先后记录了. 下面接着记录GSVA与ssGSEA方法。 这一部分之前也写过： ssGSEA与GSVA使用方法，主体内容还是那些，一个更新原因是不知道为什么，GSVA包（支持GSVA、ssGSEA、zscore与plage等多种方法）的作者更新了函数！ 单样本基因集富集分析（single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA），原理上与GSEA类似，不同的是GSEA 主要用于检测不同实验组（如实验组和对照组）之间基因集富集差异， …

Bulk RNA sequencing is the method of choice for transcriptomic analysis of pooled cell populations, tissue sections, or biopsies. It measures the average expression level of individual genes across hundreds to millions of input cells and is useful to get a global idea of gene expression differences between samples.

Bulk RNA-seq provides a list of the RNAs expressed in the samples and the relative differences in RNA levels between any two given conditions. It also provides the statistical significance of RNA expression differences between the two conditions. Bulk RNA-seq is …

2020年10月14日 · Bulk RNA-seq 和 single cell RNA-seq 的主要区别在于单细胞测序代表单个细胞（single cell），而 bulk 测序代表一群细胞（a population of cells）。 我们都知道单细胞转录组测序能够解决常规转录组测序无法解决的细胞异质性问题，对于推进医学和生物学研究进展具有极大 …