
单细胞免疫组库测序-TCR & BCR - 知乎 - 知乎专栏
10X Genomics Single Cell Immune Profiling Solution是一种在单个细胞水平同时对转录组基因表达和适应性免疫受体库进行高通量测序的新技术,其基于10X Genomics平台,可以同时获取500-10000个单细胞的5’基因表达的数据和TCR/BCR的V(D)J全长序列,在 肿瘤微环境 、感染性疾病 ...
TCR/BCR-seq:免疫组库测序,解锁免疫密码,赋能精准医疗
表观生物 正式上线 免疫组库测序 技术服务(TCR/BCR-seq),以T/B淋巴细胞为研究目标,以富集扩增决定BCR或TCR多样性的CDR区,再结合高通量测序技术,全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 技术流程. 技术应用. 分析内容. 送样要求. 细胞、组织、血液/骨髓等,样本类型和样本数量请详询. 实测数据. 图3. CDR3 区域氨基酸 motif 频率分布. 图4. VJ基因使用环状图. 图5. VJ 基因使用组间比较. 图6. 免疫组库的克隆型三层环形图. 图7. 样本多样性与 …
单细胞免疫组库(TCR/BCR-seq)测序 - 丁香通研选
2021年8月24日 · 单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近数千个细胞,可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息,结合基因的表达谱和V (D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析。 基于TCR/BCR检测的V (D)J区域靠近5'端,故免疫组库测序所用磁珠标签序列由也单细胞最末端的polydT序列改为TSO序列,构成read1+barcode+UMI+TSO的标签组成,用于单细胞的捕获识别和后续5'端RNA的抓取捕获。 如图, 凝胶珠上的序列中,barcode序列用于 …
Deep sequencing of B cell receptor repertoire - PMC
In this review, we will discuss B cell receptor sequencing (BCR-seq), a genomics approach to analyze BCR repertoire. In particular, library preparation, initial process of NGS, and the downstream analysis are emphasized. To study BCR repertoire, a process of separating B cells from diverse cell populations is the first step.
单细胞免疫组库数据分析思路分享 - 知乎 - 知乎专栏
单细胞免疫组库测序(5’scRNA + TCR / BCR)技术是一种能够在单细胞层面同时解析细胞转录组信息和 T 细胞受体(TCR)、B 细胞受体(BCR)基因重排情况的前沿技术,这项技术为深入理解免疫细胞的发育、分化、抗原识别机制等提供了可能。 在疾病研究中,无论是感染性疾病、自身免疫病还是肿瘤,它都像是一把精准的钥匙,帮助我们开启探索免疫反应奥秘的大门,为诊断、治疗和疫苗研发等应用领域带来全新视角。 一、数据来源背景介绍. 在机体免疫系统中 T 细胞受 …
Interpreting the B-cell receptor repertoire with single-cell gene ...
2022年6月2日 · Many single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) techniques can now capture both the gene expression and BCR of each B cell, which could potentially address this issue. Here, we investigated...
Benchmarking and integrating human B-cell receptor genomic …
2024年7月12日 · From peripheral blood, bulk BCR sequencing (bulkBCR-seq) currently provides the highest sampling depth, single-cell BCR sequencing (scBCR-seq) allows for paired chain characterization,...
B细胞受体测序 - 南京铭研生物
B细胞受体库测序(B cell receptor repertor sequencing,BCR-seq)是以生物信息学(Bioinformatics)全面高速分析高通量测序技术(HTS)检测靶向扩增后的B细胞抗原识别决定性表面分子,即检测BCR的H链和L链,该技术能够全面解析BCR基因重排碱基序列,以及各序列的 …
Decoding B Cells in Autoimmune Diseases Through ScRNA + BCR-Seq …
2025年2月18日 · The scRNA + BCR-seq technology, by analyzing the transcriptome and BCR clonal characteristics of individual B cells, has redefined the heterogeneity of B cells in autoimmune diseases and provided potential molecular markers for targeted therapy (such as the preferential usage of IGHV3-23 in SLE). However, current research still faces challenges ...
BCR-Seq: A Comprehensive Overview of Process, Advantages, …
BCR-Seq Technical Challenges and Solutions. Despite its importance in immune - related disease research, drug development, and other fields, BCR sequencing faces several challenges. A. Data-related challenges. a) High data complexity: The rearrangement of BCR genes leads to high sequence diversity, accompanied by numerous somatic hypermutations.