
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC-seq通过使用过度活跃的Tn5转座酶探测开放染色质来识别可访问的DNA区域,该转座酶将测序适配器插入基因组的开放区域。 然后,测序读数可用于推断染色质可及性增加的区域,以及绘制转录因子结合区域和核小体位置的图谱。
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC-seq的发展. 高通量测序(ATAC-seq)技术用于转座酶开放的染色质测定成功实现了开放染色质区域,核小体定位和调控基序的同时鉴定,同时将所需样品减少到500〜5000个细胞。利用基序推论,科学家成功地推论了B细胞系中DNA结合蛋白的结合位点。
atac-seq和chip-seq的区别? - 知乎
ATAC-seq(Assay for Transposase – Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),通过Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可接触性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。
ATAC-Seq测序分析 - 收藏夹 - 知乎
2024年3月14日 · 知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、商业、影视 ...
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2022年10月24日 · 研究通过 ATAC-seq 与 RNA-seq 绘制了恒河猴大脑的解剖学综合转录组图谱和大脑皮层的染色质可及性图谱。 首先对恒河猴大脑52个区域的416个样本进行了RNA测序(RNA-seq),揭示不同大脑区域之间的转录组差异,并比较恒河猴大脑与人类大脑在不同大脑区域的转 …
科研忍者老熊 - 知乎
公众号:老熊精读医学生物文献,科研不易,惟愿大家少走弯路! 回答数 39,获得 5,995 次赞同
三维基因组学研究的是什么?什么是 Hi-C 技术?为什么 Hi-C 技术 …
我们知道这些核小体的分布在染色质的有一些地方是致密的有一些是疏松的,而疏松的地方会空出很多裸露的片段,这些裸露的片段恰恰就是转录发生的地方,也就是我们所谓的开放区域,这个开放结构我们可以通过ATAC-seq检测到。
ATAC - 知乎
本次教程正如题目所言(《ATAC-seq实战教程:从SRA数据下载到高分辨率论文主图绘制》)是一个实战教程。 我将以一篇真实的科研论文为例,从软件安装,原始数据在SRA数据库下载开始,直到高分辨率论文主图绘制为止。
ATAC-seq质量分析该如何分析,给出的fragment图与标准图相比明 …
ATAC-seq作为表观组学研究技术之一,已经被很多组学专家所接受并已经在应用,那关于ATAC-seq技术,你了解多少呢? 要介绍ATAC-seq,不得不提到它的发展史。在染色质开放性研究领域,也是走了一段长长的路,这也是一条长江后浪推前浪的路。
蛋白质DNA互作研究,选ChIP还是CUT&Tag? - 知乎
(C) ATAC-seq(紫色)、RNA-seq(蓝色)、CUT&Tag: NEIL1(绿色)和 CUT&Tag: SATB2(橙色)交叉的维恩图,筛选出与染色质可及性相关,并且受 NEIL1 和 SATB2 直接调控的潜在基因