做完了RIP-seq、 ATAC-seq 、 m6A-seq 等项目，想对基因的某个区域高富集区域绘制peak calling的图，类似于下面展示的几种形式，你会用什么软件呢？ 当然这里的AI不是人工智能的 …

2024年9月1日 · To investigate chromatin accessibility and regulatory elements associated with m 6 A-related genes in kiwifruit, we generated ATAC-seq data from 4 different tissues including …

2024年12月11日 · 本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布；YTHDF2缺失加剧了肿瘤 …

m6A-seq 、 ATAC-seq 、RIP-seq等表观类研究中，标准化的流程分析筛选出组间差异peak所在区域以及相关基因，那么该如何直观表现基因被 甲基化修饰 的程度或蛋白结合的程度呢？

2024年12月11日 · 本研究通过RIP-seq、RNA-seq、m6A-seq、ATAC-seq等分析揭示了YTHDF2在早期效应T细胞和效应样T细胞中选择性上调和重新分布；YTHDF2缺失加剧了肿瘤 …

2024年3月7日 · In this study, by performing m 6 A-seq on chromatin-associated RNAs, we found that m 6 A regional preference arises during transcription. Nucleosome occupancy is …

该研究构建了基于 CRISPR/dCas13 (Rx) 的可编程 m6A 编辑工具，用于棉花中相关转录本的编辑，以 GhECA1、GhDi19 等转录本为对象展开实验，最终得出 TME 和 TDE 编辑器能有效改变 …

Furthermore, we performed ATAC-seq assays on diverse kiwifruit tissues to investigate the regulatory mechanisms of m 6 A-related genes. We identified 10 common open chromatin …

2024年5月17日 · ATAC-seq广泛用于染色质开放性研究，该技术利用Tn5转座酶可以接近核小体疏松区域切割暴露的DNA，获得开放染色质区段（open chromatin），然后结合高通量测序和生 …

Furthermore, we performed ATAC-seq assays on diverse kiwifruit tissues to investigate the regulatory mechanisms of mA-related genes. We identified 10 common open chromatin …